Создание лекарственных препаратов — сложный и ресурсоёмкий многоэтапный процесс. Одним из его ключевых этапов является лид-оптимизация (lead optimization), в ходе которой из набора структурно близких соединений отбираются наиболее перспективные молекулы. Важнейшей характеристикой таких соединений является энергия связывания с белком-мишенью, определяющая стабильность комплекса и потенциал молекулы как кандидата в лекарственные средства.
Основной задачей нашей группы является разработка и валидация квантовохимического метода, позволяющего оценивать относительную энергию связывания малых молекул значительно точнее существующих подходов. Для валидации метода в публичных базах данных проводится фильтрация и сбор экспериментальных значений активности соединений. Обработка данных осуществляется с применением методов машинного обучения. Для подтверждения эффективности работы исследуемого метода в реальных задачах он будет протестирован на структурах низкого разрешения, полученных методом молекулярного докинга.
В перспективе выполняемая работа позволит упростить процесс создания лекарств на ранних стадиях за счёт экономии финансовых и временны́х затрат на синтез потенциальных биологически активных соединений. Будем рады делиться с вами промежуточными результатами исследований и, возможно, вдохновить вас на ваши собственные разработки!
Новости

